第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值
在进行实时荧光定量PCR时,内参基因的选择至关重要,以下是一些选择原则:
- 始终选择表达水平高且均一的基因作为内参基因;
- 避免盲目使用常见的内参基因;
- 常用的内参基因包括GAPDH、Actin和Tublin等。
内参基因的合理选择直接影响结果的有效性。在加入内参基因后,应进行结果的计算。
二、绝对定量
绝对定量是基于标准品,测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。常用标准品包括:
- A/克隆质粒;
- B/PCR产物;
- C/cDNA(注意:用于扩增效率测定,但不适用于绝对定量)。
拷贝数的计算基于平均分子量(MW):
- 双链DNA (dsDNA) = (碱基数) x (660道尔顿/碱基);
- 单链DNA (ssDNA) = (碱基数) x (330道尔顿/碱基);
- 单链RNA (ssRNA) = (碱基数) x (340道尔顿/碱基)。
拷贝数计算公式为:
(6.022 x 10²³ 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml
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